Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47A1Q5JQC4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms