Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms