Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVEP1Q4LDE5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms