Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2Q495Y8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms