Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF9Q3BBW0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms