Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CDO1Q16878 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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