Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms