Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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