Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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