Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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