Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHI3L2Q15782 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHI3L2Q15782 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHI3L2Q15782 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms