Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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