Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SS18Q15532 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms