Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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RABEP1Q15276 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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