Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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