Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms