Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms