Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ERV3-1Q14264 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ERV3-1Q14264 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ERV3-1Q14264 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERV3-1Q14264 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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