Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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