Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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