Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms