Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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