Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TOP3AQ13472 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TOP3AQ13472 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TOP3AQ13472 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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