Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATMQ13315 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATMQ13315 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATMQ13315 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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