Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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