Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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