Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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