Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms