Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms