Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms