Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms