Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-1Q07627 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-1Q07627 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms