Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms