Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms