Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms