Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELAQ04206 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELAQ04206 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELAQ04206 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELAQ04206 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms