Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREMQ03060 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREMQ03060 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms