Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNT1Q02742 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms