Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms