Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms