Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms