Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K9P80192 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms