Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX3P78415 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX3P78415 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms