Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IP78347 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms