Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms