Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms