Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPCS3P61009 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms