Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms