Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA1P59665 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA1P59665 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms