Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms